建始朝定都长安了。关中三辅的长官，听说换了皇帝，都派人带了贡品前来参拜新主。结果在半路上，就被赤眉军的乱军给抢了。老百姓更是深受其害，这些赤眉军的散兵游勇，到处烧杀抢掠，原本以为改朝换代后，能够过几天太平日子的老百姓，又深深地绝望了。他们扶老携幼地逃出了长安。
刘恭见赤眉军这幅样子，也不像是坐龙庭的样子，跟着他们做皇帝，早晚会保不住性命的。因此，他就暗中教刘盆子，想办法辞掉这个帝位。
正月初一，又是大贺的朝期。刘恭出列说：“承蒙各位将军厚爱，把我的弟弟立为了皇帝。如今已经是第二个年头了，可是政局依然如此地纷乱，我弟弟这个皇帝也是朝不保夕啊！我们与其白白地送死，还不如去做一个老百姓吧！各位还是另请有德有能之士，来当这个皇上吧！”
樊崇只得陪着笑脸说：“这都是我等没有管教好的罪过，我们想办法管教。”
但是刘恭，说什么也不干了，马上就要带着弟弟走了。
下面的将领不干了，他们冲了上来，用手指着刘恭的鼻子：“这是你该管的事吗？”
刘恭被吓坏了，转身便走出了大殿。
被孤零零地扔在大殿正当中的刘盆子，他连忙走下了皇台，解下了印缓，趴在了地上叩着头哀求着：“你们立了皇帝却还要做贼，烧杀抢掠、人心尽失，这都是因为我这个皇帝不称职，我不如早早让贤，免得死无葬身之地，大爷、大叔你们就可怜可怜我吧！”
樊崇等人惭愧无比，都离席跪拜说：“我等确实不像样子，辜负了皇上，从今以后再也不敢放纵部下了。”
于是赤眉军的各个部分，都开始约束部下，他们都紧锁了寨门，这些乱兵终于太平了一段时间，百姓们也开始陆续返回长安了。
可是好景不长，刚过了不到一个月，赤眉军断粮饷了。他们便冲进了皇宫，把整个皇宫抢了一个精光，然后放了一把大火，把长安的所有的皇宫都烧光了。
赤眉军簇拥着刘盆子，一路向西觅食，先攻破了郿县，再转向西北攻入了安定、北地郡。不料他们遭到了一场罕见的暴风雪，被冻死了很多的人马。他们又不得不返回了长安，这时的长安城已经没有几个人，没有几间房子了。赤眉军无以为食，便开始挖掘汉代的陵墓了。
他们先后挖了从汉高祖刘邦到汉平帝的十余座墓葬，挖到了无以胜计的陪葬品。其中以汉武帝的茂陵最为奢华，汉代的皇后们都是穿着金缕玉衣入殓的，而且尸体也作了防腐处理，其中较为典型的是吕雉的尸体。由于她保存得非常完好，面目栩栩如生，竟然遭到了这帮莽汉的轮奸。
刘秀跨出了河北，他北渡黄河的第一件事，就是打算打下洛阳这一座，已经成为全国中心的城市，他派出了吴汉、王梁、朱祜、万修、贾复、刘植等人，率领着强势的大军，开始围攻洛阳。但洛阳城在朱鲔的领导下，竟然坚守了三个多月，河北军未能攻陷。
刘秀为了减少进一步的损失，便派朱鲔原先的手下的岑彭去进行劝降。
岑彭撤去了大军，孤身一人站在了城下，拱手向着箭楼说：“恩公别来无恙，一别别了数年，没想到今日在城前对垒。”
“君然久违了，数年之间竟然已经沧海桑田了。”朱鲔在城上答道。
“我从前在恩公手下效力，后来承蒙推荐官至太守，我也经常想着报恩。如今赤眉军已入了长安，更始朝已经消亡了。我们的建武皇帝受天命之托，已经尽有了河北之地，百姓归心、豪杰云集。现在亲帅大军来攻洛阳，更始的大势已去了，恩公死守这座孤城，又是何苦呢？”岑彭对着城上说。
朱鲔也知道死守下去，总有一天会城破的，那时候的玉石俱焚是免不了的，但他同刘秀有杀兄大仇啊！他不敢投降啊！所以他说：“当年我参与了谋害刘縯，又劝阻更始帝不要让萧王北上，现在我自己知道罪恶深重，所以不敢投降。”
岑彭回营禀告了刘秀，刘秀沉吟了片刻，他想着，现在面前是一座完好无损的洛阳城，和成千上万个将士的性命，这些都应当比个人的恩怨重要得多。何况朱鲔也是各为其主，他原本也是个忠义之士，不同于李轶这个反复无常的小人。他决断地说：“成大事者，不计个人的恩怨，朱鲔如果能够投降，他的性命和官爵都能保全，我指着黄河发誓，我决不食言。”
在刘秀的大义凛然下，朱鲔终于投降了。
刘秀乘车驾进入了洛阳的宫中，他一路望着那巍峨的宫殿，他想着求学路过的时候，想着当司隶校尉的时候，这一幕幕的往事，真可谓恍如隔世了啊！
不久，刘秀同郭圣通的第一个儿子刘疆便出生了。而他派傅俊护送的阴利华也到了洛阳。他们仅仅离别了两载，但已经是物是人非了。刘秀已经无法面对这个，自己心目中的蝉儿了。
邓禹在西线的攻势，也已经取得了相当的进展，他渡过了黄河，占领了陕西的夏阳县，在衙县他又打败了数万人的残余的更始武装，也进入了三辅地段。
邓禹治军严明，对百姓秋毫无犯，每天都有数以千计的百姓前来寻求保护，邓禹总是亲自停车慰问，男女老幼的百姓对他无不感激于心。因此，建武朝的爱民之声，很快便传遍了关中。
邓禹步着稳扎稳打的战略方针，先不与赤眉军正面相对，便率军攻入了上郡、北地、安定三郡。
但是，邓禹的部下发生了内讧，他的部将冯愔为了争功，竟然杀死了另一个部将宗歆。邓禹报告了刘秀，刘秀派尚书宗广前去处理，结果正如刘秀所料，冯愔的部将黄防，反而擒拿了冯愔，一同押送到了洛阳。
第二年，邓禹趁赤眉军外出觅粮之机，终于率兵南下，攻入了已经是一座空城的长安，他驻军在昆明池，下令修整了被赤眉军祸害了的诸帝的陵寝，又把西汉十一帝的牌位护送回了洛阳。因为刘秀要建立的是汉帝国，而这十一帝又是刘秀的祖宗，邓禹的这样的做法，使刘秀感到了无比的欣慰。
但邓禹在长安却是屡屡碰壁，他攻击汉中王刘嘉，但他大败而归。但后来刘嘉大败于赤眉军，势劣了来投奔邓禹，但是又出事了。因为汉中王刘嘉的国相李宝出语无狀，邓禹恼羞成怒便下令杀了李宝，致使李宝的弟弟又带着叛军反击了长安。同时又攻杀了邓禹的数名部将。
屡次把事情搞砸了，邓禹的威信便大幅度地下降了，而内部矛盾也更加尖锐化了。有不少的人，都悄悄地离去了。而就在这进退维谷之际，赤眉军又向长安发动了大规模的进攻了。
邓禹连一点防备也没有，接战后便大败于赤眉军，他不得不退守高陵，驻守高陵的邓禹，粮草都吃完了，士兵们只能挖野菜果腹。
战报发到了，刘秀意识到统军作战不是邓禹的特长，因此下旨召他回京。但邓禹没有脸面回京，便没有听从刘秀的召唤，还是率领着残兵败军，在关中苦苦地支撑着。
刘秀用冯异，接替了邓禹，去完成西征的任务。
刘秀亲自送到了黄河的边上，并且钦赐了一柄有美玉装饰的宝剑，并且语重心长地嘱咐道：“关中接连遭遇了王莽、更始的乱政，又受到了赤眉、延岑的祸殃，百姓遭孽、生灵涂炭，苍生已经无所依存了。此次出征，不仅仅是要攻城掠地，更加要安抚百姓。众将领虽然英勇善战，但是还是有纵兵抢掠的毛病的，爱卿一向治军严明，要继续发扬，无论如何要安定地方啊！”
冯异跪地顿首，保证谨遵圣命。然后，义无反顾地带领着大军，往西进发了。