由于ZTI的加入，佣兵们与生化幽灵的对决中慢慢占据了上风，并且压制住生化幽灵。
生化幽灵也在一步步的进化，终结者再一次发生了巨大的变革，在幽灵猎手的压力下，失去了原有的核能护盾，取而代之的是利用核能与生化病毒凝聚一枚能量弹，发射到人群之中。
全新的终结者浑身缠绕着核能与生化病毒融合后的产物，就像深渊之火，佣兵们便称呼它为——深渊终结者！
而ZTI也成功破解了部分生化病毒的构造，并加以应对，以空投的方式投送给在前线奋战的幽灵猎手。
而这些幽灵猎手得到了新武器之后，有了一击秒杀普通生化幽灵的能力，并且二次纳米强化之后，免疫了深渊终结者的感染，双方的大战再次拉开了序幕。
而生化战争大胜之后，联合政府以ZTI拥有大规模杀伤性武器为借口，对ZTI展开了围剿，先是剿灭了一个潜伏者的营地，后来又毁灭了绝命之谷与瓦尔基里的生化研究基地。
ZTI向潜伏者求助却被潜伏者抛弃，无奈之下，只能把所有没有完成的纳米尖兵产物扔在了一个遗迹内。
只带着纳米尖兵技术和科研人员离开。
但是联合政府依旧不依不饶，派出精英小队GRX围剿ZTI的残存势力。
数年之后，ZTI正式更名为Blitz！并且将自己研发的新型生化武器扔到了一个美丽的国际性水上都市——水之城。
并且嫁祸给潜伏者。
另外一边，被遗弃在遗迹中的未完成的纳米尖兵，发生了二次变异，进化出了全新的装甲终结者，能够打烂城墙，逃离遗迹，并且入侵到了一个保卫者的要塞之中。
一个纳米尖兵仅存的记忆是自己的家人被生化幽灵残忍的杀害，为了复仇，加入ZTI的强化人计划，但是成为了一个失败品被抛弃在遗迹中。
绝望之中，这个人遇见了一名少女，这名少女就是被ZTI作为纳米尖兵技术批量生产的作为“剑灵”的神秘少女之一。
ZTI通过纳米技术将剑灵封印在机械剑“Ghost Bde”中。
而这个少年通过这个少女获得了纳米尖兵的力量，参与到了第二次生化战争之中，被佣兵们称为——恶魔剑客！
但是好景不长，在一次又一次的与生化幽灵厮杀中，他的仇恨成为了吞噬他的病毒。
在杀死无数的生化幽灵和其他无辜的生命之后，杀死无数生化幽灵导致与他息息相关的剑被生化病毒侵蚀，最终成为折寿的魔剑。
在命运的安排中，恶魔剑客最终还是死在了自己的家乡。
数年以后，GRX精英小队在结束诸神竞技场的战斗之后，顺着联合政府和Blitz的情报追查，为了调查反叛的ZTI寻找恶魔剑客。
最终在神秘之岛的结界中发现了恶魔剑客的尸体，没曾想惊动了这个地方的生化幽灵，与生化幽灵战斗的过程中，又惊醒了沉睡在魔剑Ghost Bde中的神秘少女。
被生化幽灵侵蚀的神秘少女把自己的意志注入了恶魔剑客的身体，并且发生变异，成为具有寄生孢子的恶魔终结者！
所以，ZTI为人类抗击生化幽灵做出了卓越的贡献，最终却成为联合政府绞杀的目标，恶魔剑客斩杀无数生化幽灵，却被病毒感染，成为新的恶魔终结者。
这些事情，不由得让灵狐者开始怀疑起来，她曾经所效忠的对象，到底是什么人？
看着眼前的这样抗击生化幽灵的战友，有不少人甚至早早地就死在了生化幽灵的潮水之中。
如果说这些都是联合政府为了维护自己的利益所造成地结果……
灵狐者不敢想象，但依旧知道了Blitz为什么会疯狂到摧毁巨人城的原因。
因为巨人城是一个以科技，工业为核心的科技城市，说白了，这个城市就是联合政府的兵工厂！
源源不断的武器严重压缩到了Blitz的生存空间，所以，一个名为泰坦的不明生物被投放到这个城市的最中心。
随之而来的，便是源源不断的生化狂潮与被感染的普通士兵们。
灵狐者神情复杂的看着眼前的这个老人，不知道该说些什么。
因为GRX精英小队，她也曾参与过，甚至还是围剿Blitz的主力！
“呵呵呵，现在说这些也没什么用了，这个世界，应该比联合政府要好很多吧？”
“的确，虽然还是有些不和谐的地方，但总比曾经那个战火纷飞的世界要好很多。”
“呵呵……小丫头找我出来，是不是有什么事要帮忙？”
老者一眼就看出来灵狐者的心事，结合一下她刚刚说的那些情况，自然直到现在是什么情况困扰到她，和曾经的ZTI一样，扩张太快，底子太薄，说白了就是平地上盖一座哈利法塔，一点地基也没有。
“您都猜到了还问我？”
“哈哈哈！好！我答应你，刚好想看看一个和平的世界是什么样子，这里的所有人，都归你管！”老者哈哈一笑，非常豪迈的大手一挥，就送出了小几百人的超大型研究团队。
要知道这些可是Blitz的精英研发团队，有了他们，别说泰坦了，克洛诺斯都能给你造出来。
“战斗人员站左边，科研站右边！”
一声令下，这一圈人杂乱而有序的分成两队，这才让灵狐者意识到原来真正的战斗人员只有七个，三个幽灵猎手，三个复仇女神以及一个救世主。
刚刚也是他们七个站在最前方，高大的身影保护住后面地所有人……
因为在原来的世界里，他们可都是为了帮助人类抗击生化幽灵而战死，一丝不苟，无畏正义！
但是自从联合政府一项代号：零的纳米尖兵计划成功之后，无数优秀的纳米强化人一个接一个的出现，他们强大的战斗力渐渐取代了全球风险内的老兵们。
这也是灵狐者和曼陀罗慢慢从前线转到幕后的原因之一。
“好！那你准备一下，我让斯沃特带你们出去看看，不想去的可以直接去曙光号上，海思博士已经在那里研究了！”
“海思那个小丫头也来了？”老者的眼睛一亮，惊讶的问道。