共工撞了两次不周山，险些将不周山撞断。天河之水倾斜而下，人间生灵涂炭。尧成了最为倒霉的帝王。十个太阳引起的干旱，以及近百年的特大洪水，谁遇见过呢？为民着想的尧，明明有很大的政治抱负，却陷在一个死结里——迁都、赈灾、求共工。
无奈的他只能兵行险着，将大权移交给舜，启用鲧偷息壤治水，自己专心与共工周旋。九年时间，鲧没有治好水，舜也羽翼丰满，共工也发现了尧的用心，尧只得承认失败，让出了主导世界的中心地位，并让舜将自己流放幽州，让权力更加集中到舜身上。
舜祛除四凶，配置贤臣，为治水清除了障碍，奠定了基础。他自己拥有重瞳，一个瞳孔看当世，一个瞳孔看未来，于是启用了拥有三漏异相的禹，大力支持他采用疏的方式治水。禹是践行“态度要比能力强，情商要比智商高，执行力要比想象力更靠谱”的典范，在西王国和郁华子的帮助下，考察了全国的水系，制定了治水的方略。并用自己控制情绪的能力，团结了一切可以团结的力量，形成了治水的统一战线。其中，出力最多的，就是西王母和她的女儿瑶姬。
西王母给禹派出了七天将，帮助他治水。然而七天将能力有限，只能当大禹的警卫员而已。这也是西王母的高明之处，让大禹时不时的来求救。大禹是能伏下身子的，一次次的求西王母，治理黄河时候，西王母派来应龙，灭了水怪天吴，罔象。禹觉得应龙是得力助手，便央求西王母让应龙加入治水队伍，西王母同意了。
瑶姬不想输给母亲，她给大禹带来了会地行术的七地将，又给大禹介绍了能力劈华山的巨灵神秦洪海。西王母觉得巨灵神秦洪海法力太强，又致生灵涂炭，将巨灵神带走了。不过大禹没有受此影响，继续上溯黄河治理，与水神共工正面争锋于雍州。
水神共工派出了蛇身九头的相柳应战。相柳的偷袭让大禹措手不及，不过幸亏有赤碧二圭保命，才不至于殒命。瑶姬邀请了日中五帝，二十八星宿来战相柳，相柳大败，但身上的剧毒也让日中五帝，二十八星宿吃尽苦头。共工乘乱出现，击败五帝二十八星宿七天将，与禹正面对峙。
大禹以凡人之躯，对抗天神，展现了人类的勇敢和信念，也让战争的双方分出了正邪。瑶姬用法宝白莲花将大禹救出，然而却无法抵消战败的过错。西王母再次出面，让九天玄女布下天网结界，辅以四象阵法，以禹为饵将共工引入后剿杀。然而百密一疏，共工的女儿后土出现，改变了战局，此刻大禹身边的郁华子出手，将共工坐骑黑龙收服，共工见战局平衡已失，于是突击九天玄女，趁乱逃出结界，而后怒撞天柱，天柱倾倒，人类几乎灭绝。
太上道君，西王母、舜、禹望着茫茫洪水中的人类死尸，慨然而叹，之后就达成了一个共识。让天神回到天上，让人类自己发展。但这个烂摊子让人类自己收拾吗？人类都快灭绝了。当然不，西王母、舜、禹及其带领的臣下留下治理洪水，而造人繁衍、炼石补天的事，就交给女娲娘娘了。