除了鬼灵宗十三艘飞舟的舵手，龙三公主与苏凌天杀光了飞舟上所有的鬼灵宗弟子、长老，救了青云学府的女学员、青云宗女弟子和女长老。
苏凌天命令十三个舵手返航回青云学府内府。
苏凌天就站在鬼灵宗旗舰舵手旁边，看着他们操纵飞舟，并亲自试驾，由龙三公主监视鬼灵宗旗舰舵手。
到达青云学府内府，苏凌天已经学会了驾驶飞舟，就杀了十三个鬼灵宗飞舟舵手。
青云学府和青云宗被救的三千多个女学员、女弟子、女长老纷纷向苏凌天下跪磕头，感谢苏凌天的救命之恩。
龙三公主在消灭最后一个敌人之后就回到隐身的苏凌天佩在腰间的玉佩的小世界中，所以众人只能感谢苏凌天一人。
众女请求苏凌天担任青云宗宗主兼青云学府府主。
苏凌天现在是有见识的人，最近频繁同二流宗门交手，对五流宗门还真的看不上眼，不过见三千多女学员、女弟子孤苦无依的样子，觉得她们挺可怜的，她们是因为自己而受到池鱼之殃，自己必须照顾她们。
于是苏凌天就自作主张，自封为青云宗宗主兼青云学府第一府主，主持长老阁，多数时间修炼和闭关，一般不过问宗门和学府事务，但对宗门和学府事务有绝对的话语权。
苏凌天封青云学府外府天宁院长老徐世敬为青云宗长老阁第一长老，主持青云宗内部事务。
徐世敬破格录取苏凌天，苏凌天对徐世敬心存感激，现在发达了，不忘提拔徐世敬。
苏凌天封宁雨溪、邵雪琪、“陶莹莹”的共同师父、美女长老水清越为青云学府内府第二府主兼长老阁第二长老，主持青云学府内府日常事务；
封躲在异火炼丹室，劫后余生的看门长老余长卿为青云宗长老阁第三长老，掌执剑堂，负责刑律。
余长卿原本就是执剑堂的长老，负责刑律，只是与原执剑堂堂主、执剑长老柯书圣不和，受柯书圣排挤，被发配到异火炼药室门房。
他的能力还是有的，苏凌天去异火炼药室的次数多，在青云学府最熟悉的长老就是余长卿。
调天宁院院长崔世英任青云宗长老阁第四长老，负责打理青云宗的产业，天宁院副院长升任院长。
封邵雪琪为青云宗长老阁第五长老，她不再随水清月修行，而改拜在苏凌天的门下，成为苏凌天的大弟子。苏凌天传她神级高阶功法“傲苍武帝诀”，与她早就有师徒之实，如今正式拜师，补了名分。
苏凌天正式收邵雪琪为徒有三重考虑，第一培养自己的势力，第二她的天资很高，不想她因为没有名师指点而被埋没，第三苏凌天看出邵雪琪暗恋自己，希望通过正式收她为徒，让她对自己断了念想，苏凌天不想耽误她。
天罗大陆尊师重道，有“一日为师，终身为父”的说法，所以师生恋被认为是乱伦。
邵雪琪如今的修为是地极境巅峰，已经是青云学府外府长老的平均水平，其实力远超青云学府内府学员，天资在苏凌天退出青云学府之后在青云学府内府学员中排第一。
如果不是因为苏凌天的关系，过几年她也有资格担任青云宗长老，如今只是提前。
邵雪琪对苏凌天收她为徒喜忧参半，喜的是有名师指点，事半功倍，大道可期，忧的是再暗恋苏凌天，必被人视为乱伦，在背后指指点点。
青云学府内府和青云宗所有的建筑都被烧毁，或者被强者轰塌。青云学府内府、青云宗的学员、弟子、长老无处安身，苏凌天就让他们暂住在飞舟中，并从黑石城请来建筑工匠，购买建筑材料，在原址按照原样重建筑青云学府内府和青云宗。
苏凌天这次战斗获胜，从鬼灵宗弟子、长老身上搜刮了大量兵器、装备、钱财，价值超过一百亿枚银币，一艘大型飞舟的价值超过一百五十亿枚银币，而苏凌天缴获了十三艘大型飞舟。
重建青云学府内府和青云宗根本就不用苏凌天掏钱。
徐世敬、水清月、余长卿、崔世英得苏凌天提携，都对苏凌天表了忠心。邵雪琪暗恋苏凌天，忠心自是不用置疑。
苏凌天总结经验教训，青云学府学员、青云宗弟子彼此冷漠，没有同门之谊，在面对外敌入侵时不是想着共同抵抗敌人，而是想着交出自己人，讨好敌人，向敌人乞求活命，这样的学府、这样的宗门是没有前途的。
于是苏凌天召开高层会议，召集长老阁五个长老，和外府十三院的院长、副院长开会，提出青云学府和青云宗的新规“团结，友爱，平等，互助”，禁止同门之间私斗，禁止贵族学员欺压平民学员，禁止高门大户学员欺压小门小户学员。
如有私斗，不问情由，不问对错，首先各打五十大板，再交由执剑堂审理，如有贵族学员欺压平民学员，高门大户学员欺压小门小户学员，交由执剑堂审理。
挑事者、以大欺小者，恃强凌弱者视情况处以关小黑屋、鞭刑、做杂役、逐出学府或宗门等责罚，其主要授业长老负连带责任，扣除月奉。
季度考核和年底考核，学员、弟子之间的比试不可避免，但是必须点到为止，无论是失手打伤还是故意打伤同门，都要受执剑堂刑罚，将同门打成什么样的伤，就要被执剑堂打成什么样的伤。
青云学府内府、外府均采取末位淘汰制，每年淘汰百分之十，毕业考试的时候内府弟子只有大约一半的人能从内府毕业，再从中择优录取五分之一至二分之一，进入青云宗旗下的各个产业工作。
末位淘汰同样能激励学员修炼，但却与鼓励学员之间私斗不同，不会伤害同门感情。
青云宗财力充足，长老的月俸增加为原来的十倍，年底进行绩效考核，视绩效发放相当于零至六个月薪俸的奖金，平均奖金为三个月薪俸。这是激励授业长老和管理层。
苏凌天亲自己担任飞行教练，在青云学府、青云宗挑选了二十六名精英学员、精英弟子、长老，包括长老阁五位长老、宁雨溪在内，担任飞舟舵手。
苏凌天精神力九十三级，非常强大，看别人驾驶飞舟就学会了，而他教的这些舵手修为普遍是地极境初期到中期，后期的都很少，精神力普遍是四十至四十五级，学了一天才学会，练了三天才能单独驾驶，无需苏凌天陪伴在侧。
于是苏凌天根据他们的熟练程度，分配他们分别担任正副舵手。